Proje okullarında görev yapan yönetici ve öğretmenler, istedikleri takdirde ya da görev sürelerini tamamladıklarında ilgili mevzuat hükümlerine göre başka okullara öğretmen olarak atanabilirler.
Milli Eğitim Bakanlığı Özel Program ve Proje Uygulayan Eğitim Kurumları Yönetmeliği'nin "Yöneticilik ve öğretmenlik görevinden ayrılma" başlıklı 15. maddesine göre bu geçişler takvime bağlı olmaksızın gerçekleştirilmelidir.
Proje okulundaki bir öğretmen ayrılmak istediğinde, tercihlerine göre bir okuldaki boş norm kadroya atanabilir veya il/ilçe milli eğitim müdürlüğü emrine çekilerek norm kadro fazlası atamalarında tercih hakkı verilebilir.
Mevzuat olarak, öğretmenin ayrılık talebi Milli Eğitim Bakanlığı Öğretmen Atama ve Yer Değiştirme Yönetmeliği'nin "İhtiyaç ve norm kadro fazlası öğretmenlerin yer değiştirmeleri" başlıklı 53. maddesinde yer alan hükümlere tabidir.
Yönetici pozisyonunda bulunan bir kişi, yöneticilikten istifa ederek proje okulundan ayrılmak istediğinde ilgili mevzuat Milli Eğitim Bakanlığı Eğitim Kurumlarına Yönetici Görevlendirme Yönetmeliği'dir.
Bu durumda, yönetici görevinden ayrılma talebi, bulunduğu eğitim kurumunda açık norm kadro olması ve istemesi halinde aynı okula atanması veya ilçe içerisinde durumuna uygun bir eğitim kurumuna öncelikli olarak atanması şeklinde değerlendirilir.
Eğer ilçe içerisinde uygun norm kadro bulunmuyorsa, il içerisinde istekleri de dikkate alınarak alanlarında açık norm kadro bulunan bir eğitim kurumuna öğretmen olarak atanabilir.